年幼的爱力克兄弟十分思念去世的母亲，不惜触犯炼金术中最大的禁忌，进行了人体炼成。可是炼成失败了，哥哥爱德华失去了左腿与右臂，弟弟阿尔冯斯失去了肉体，只能把灵魂附身在一副铠甲上。为了偿还他们自己的罪，找回失去的一切，兄弟二人踏上了寻找传说中的“贤者之石”的旅程。几年后，一位右臂与左腿都是由“机械铠甲”替代的国家炼金术士出现在人们的眼前，他被称作“钢之炼金术师”。

　　在同学的眼中，立石亚由（堀江由衣 配音）是一个长相漂亮学习优秀的万能美少女，个性有些冷淡又酷酷的她成为了学妹们心目中的偶像。可是实际上，亚由其实是一个非常普通的女孩子，和所有的青春期女孩一样，她也有着她的梦中情人——对所有人都很和蔼温柔的架地哲士（神谷浩史 配音）。作为 亚由的朋友，佐仓仁菜（神田朱未 配音）将这一切都看在眼中，单纯善良的仁菜决定，利用自己能够使用魔法这一优势，来帮助亚由向架地告白。
　　可是，仁菜菜鸟级别的魔法水平帮了倒忙，竟将告白魔法施展到了架第的好友辻合宏基（千叶进步 配音）的身上，多亏有同行桐岛由多（林勇 配音）的帮助才得以脱险。就这样，轻松愉快的校园爱情故事围绕着着五人展开了。

　　人的一生就像在一条充满分岔点的路上行走，当面对每一个十字路口时，不同的抉择会导致不同的命运。

　　在遥远的莱茵凡王国，王妃诞下了一对双胞胎，可是这对可怜的婴儿自打出生，就背负了残酷的命运。邪恶的教主预言，其中的女婴会在16岁之际成为毁灭世界的可怕存在，因此，刚刚出生的帕西菲卡卡尔苏（折笠富美子 配音）就被下令处决。出于怜悯，帕西菲卡被一对夫妇收养，隐姓埋名的长大。在新家里，帕西菲卡认识了没有血缘关系的的哥哥夏浓卡尔苏（三木真一郎 配音）和姐姐拉克薇尔卡尔苏（大原沙耶香 配音），三人过着平静而快乐的生活。
　　可是，命运不肯放过帕西菲卡，帕西菲卡依旧活着的消息走漏到了教会中，面对着接踵而来的杀手和人们的敌视，在哥哥的保护下，帕西菲卡踏上了逃亡的旅程。随着年龄的渐长，“废弃公主”毁灭世界的预言是否会成真？

　　这部《新北斗神拳》OVA依然以小说为蓝本改编而成，作者虚构了一个人类文明衰亡的环境，友情、亲情……一切理智下建立的秩序需要由力量来维持。主人公健次郎背负着沉重的宿命，在一次次生死搏杀的同时体验着人生的悲欢离合，也昭示了人性的可贵。和《圣斗士冥王十二宫》一样，这部OVA动画也采用了3DCG 和2D画面结合的方式，在第一话的声优名单里，你还可以惊喜的发现子安武人这样的名字。相对于老版本，《新北斗神拳》在情节上相对紧凑了许多，原哲夫式的紧张气氛、健次郎李小龙般的动作特点都变得越发明显。充满张力的画面，也许可以帮FANS们找回当年对那份北斗神拳的痴迷感觉。

大地在污染和环境灾害的双重打击下，已经处在崩溃的边缘，为了生存，人们创造了一个与世隔绝的都市，叫做ECOBAN(这个名字由ecology和ban合并起来，意思是“毁灭生态”)，而这个都市完全靠大地的污染物苟延残喘。 　　但是，只有极少的经过挑选的人才可以进入这个隔绝的都市，这些人成为城市中的特权阶层，至于更多的其他人，则无助地被抛弃，暴尸于无尽的荒野中。 　　ECOBAN的能量之源就是污染物，生活在ECOBAN的人衣食不缺，而在另一个叫MARR的地方生活的难民却食不果腹。尽管如此，ECOBAN的人还想消灭MARR的居民来获得更多的污染物。 　　过了一段日子，突然有报道说这片土地的污染程度正在下降，因而有很多人开始希望整个大地又能恢复生机。 　　冲突发生了，因为有一些政府官员决定继续污染土地，这样的话他们就能保持住在都市里面的种种特权。 　　这时，有一个入侵者偷偷进入了ECOBAN，并且疯狂地作案，当地的警察完全无所适从。JAY是警方的头目之一，她疲于奔命地追踪着入侵者，却发现这个人是自己的初恋情人。在工作责任和儿女私情之间，JAY到底应该怎样取舍？同时，安全部门的首脑人物SIMON也深深爱着JAY，当他也发现了SHUA的存在时，又会发生什么？ 　　那是生活在环境污染的黑云之下的所有人的希望。 　　那也是被种种压力逼得喘不过气来的人们的希望。 　　那，也是我们的英雄给他深爱的人的承诺。

　　宗介与九龙决战之后，宗介继续担任千鸟的贴身保镖，可是他的性格无疑又为校园的安全和世界的和平蒙上了层层阴影，作为学生会副主席的千鸟当然不能袖手旁观，在宗介作出一些危险的事情之后，一场痛打是免不了的……